杭州等很多城市在申遺前就已經(jīng)啟動對運河的保護(hù)。當(dāng)運河因為申遺而重新走進(jìn)人們的視野時，人們發(fā)現(xiàn)斷流、淤塞、污染，甚至了無蹤跡的現(xiàn)象，竟然成為常態(tài)，8年的申遺之路走得并不輕松。各地開展了清理、整頓、修復(fù)、疏通等一系列繁雜而艱巨的工作。
為解決水利、交通、文物等多頭管理存在矛盾的問題，文化部出臺了《大運河遺產(chǎn)保護(hù)管理辦法》并在2012年10月1日起正式實施。中國35個運河城市還簽署了《大運河遺產(chǎn)聯(lián)合保護(hù)協(xié)定》，承諾將共同協(xié)作聯(lián)合保護(hù)運河遺產(chǎn)。
運河杭州段是現(xiàn)有申遺城市中唯一經(jīng)過主城區(qū)的河段。記者從杭州市京杭運河（杭州段）綜合保護(hù)委員會獲悉，截至2013年年底，杭州市投入運河綜保項目的投資總額已達(dá)202億元，這部分資金包括投向土地整理、企業(yè)搬遷、歷史街區(qū)保護(hù)、城中村改造、配套基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)、綠化景觀提升、水質(zhì)改善等方面。據(jù)新華社